Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms