Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms