Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Reep6Q9JM62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms