Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx6Q9JKK1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms