Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms