Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1fQ9JIS7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms