Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnmb4Q9JIN6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnmb4Q9JIN6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnmb4Q9JIN6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnmb4Q9JIN6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnmb4Q9JIN6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms