Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl1Q9JI74 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl1Q9JI74 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms