Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms