Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem27Q9ESG4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem27Q9ESG4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms