Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp29Q9ES63 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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