Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tnfrsf23Q9ER63 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf23Q9ER63 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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