Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aph1cQ9DCZ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms