Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rexo2Q9D8S4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms