Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc52a2Q9D8F3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc52a2Q9D8F3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms