Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4bQ9D8B3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms