Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms