Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox2aQ9D4Y3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms