Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Syce1Q9D495 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms