Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms