Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms