Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem50aQ9CXL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms