Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmed5Q9CXE7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms