Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MINDY3Q9CV28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms