Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms