Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930550L24RikQ99PA7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930550L24RikQ99PA7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms