Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4Q99P72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms