Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms