Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms