Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brms1Q99N20 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brms1Q99N20 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms