Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ms4a4dQ99N05 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ms4a4dQ99N05 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a4dQ99N05 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ms4a4dQ99N05 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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