Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KarsQ99MN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms