Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms