Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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