Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim59Q922Y2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms