Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf7Q922B6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms