Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng8Q8VHW2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms