Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhdc3Q8VEM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhdc3Q8VEM9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms