Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.4 ms