Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms