Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy2Q8R4C2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy2Q8R4C2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms