Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pof1bQ8K4L4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms