Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpt1Q8K3A2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms