Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd2Q8K2Z4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms