Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp27Q8CEG8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp27Q8CEG8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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