Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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