Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4aQ8BW72 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.1 ms