Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms