Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Vipas39Q8BGQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vipas39Q8BGQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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