Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2lQ7TS74 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms